Vrcholem motocyklu je zcela nový vodou chlazený čtyřtaktní motor Minarelli 125cc Euro 5. Motor nejnovější generace schopný zajistit nejvyšší možný výkon, a přitom splňuje homologační předpisy Euro 5. Motor, který pohání Fantic 125 Scrambler, je technicky vyspělý, vybavený elektronickým vstřikováním paliva, antihoppingovou spojkou a systémem Variable Valve Actuation. Systém VVA díky aktuátoru umožňuje, aby byla k dispozici nejúčinnější a nejvýkonnější vačka při jakýchkoli otáčkách a vždy zaručuje maximální zrychlení. Nová hlava válců nabízí účinnější spalování, které se projevuje vyšším výkonem, nižší spotřebou paliva a menší produkcí CO2. Antihoppingová spojka zabraňuje zablokování zadního kola, když jezdec zpomaluje, a zajišťuje tak větší bezpečnost.